糖尿病
在过去的十年中，儿童T2DM（二型糖尿病）出现了令人担忧的增长， T2DM是以往几乎完全在成年人发生的疾病。建议所有超重的或至少有两项高风险因素的儿童应当在10岁或青春期开始T2DM检查，其后每2年进行一次。风险因素包括一级或二级亲属的T2DM家庭史、属于一定种族人群、或具有胰岛素抵抗征兆（高血压、血脂异常、黑棘皮病或多囊卵巢综合症）。
代谢综合症（MS）
肥胖成年人的代谢变化被总结为所谓的MS。MS的定义依不同的典据而不同。甘油三酯在110 mg/dl或1.2 mmol/l及以上为异常，HDL设置在40及以下，腰围在90%及以上（依据国家健康和营养调查III）为异常，血压也同样在90%及以上为异常。严重肥胖儿童的MS风险接近50%，风险随BMI每增加0.5-U而增长。
雄性激素过多症
在青少年女孩和青年妇女，中心性或腹部脂肪过量与雄性激素过多有关。肥胖的女性青少年胰岛素抵抗与腹部脂肪高度相关。肥胖和过度肥胖会使青少年女孩处于月经紊乱和早期多囊卵巢综合症的高风险之中。
心血管疾病
肥胖引起各种心脏结构变化和血液动力的改变。过多的脂肪堆积导致血量和心脏输出量增加。睡眠呼吸暂停和与肥胖有关的肺通气不足可能产生肺动脉高血压。在病态肥胖症，这些异常可能导致心脏病。儿童肥胖倾向于内皮功能障碍、颈动脉内膜增厚，以及早期出现主动脉和冠状动脉脂纹（fatty streaks）与纤维斑块（fibrous plaques）。儿童肥胖是否象成年人那样，增加心肌梗死、中风、某些恶性肿瘤的风险，目前尚未得到证实。
高血压在所有年龄上，肥胖者普遍出现高血压。儿童肥胖是儿科高血压的首要病因。
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