豇豆的主根和地下茎是豇豆的主要部位，容易产生病害。病害严重的地块，宜与葱蒜类蔬菜和禾本科作物轮作3-4年。进行高畦或深沟窄畦栽培，经常清沟排水，降低湿度，及时清除病株残体，烧伤或深埋。
豇豆锈病
多发于生长中后期，主要为害叶片。严重时，茎、茎、叶柄和荚果都会受到损伤。秋季多雨的年份容易引起疫情。长期连作，地势低洼，种植过密会加重病害。防治初期可采用以下农药喷剂：25%湿粉剂、2000倍湿粉剂、5%枯锈膏、800倍液、50%多菌灵湿粉剂500倍液等，每7-10天喷剂一次，连续2-3次（使用三唑酮的间隔可延迟至15天。
煤霉病
豇豆自出真叶后即发生，是收获前最严重的病害。主要为害叶片，引起落叶。高温高湿适宜发病。防治时应避免过密播种，以利于田间通风透光；田间感染的叶片应及时清除，减少再感染源；在疾病开始时，用喷雾剂来控制感染。以百菌清可湿性粉剂（75%倍液，600倍液）和多菌灵（40%胶悬液，800倍液）为最佳选择。
病毒病
秋豇豆较重。发病初期，病株叶片上出现黄绿色的花斑，随后深绿色部分逐渐凸出，形成疣状，叶片变形；重病植株生长缓慢，矮小，花荚少。早期控制蚜虫是主要方法，尤其是在干旱年份；加强栽培管理，提高抗病性。
豆荚蛀虫
豇豆蛀虫又称蚕豆蛀虫，是豇豆的主要害虫。每年4-5代。除及时清除田间落花荚、清除受损叶荚、集中焚烧荚果外，主要采用化学防治。化学防治的策略是"控花不结荚"，即在豇豆开花期第一次，然后每隔7-10天，连续2-3次。最佳喷施时间为上午8点前花瓣开放，此时昆虫能充分接触液体；拟除虫菊酯及其复方制剂可用作杀虫剂，如双嘧达莫、异丙嗪、甲硝唑等，如在结荚后使用，必须在采摘后喷洒。严禁采摘前喷洒，以免中毒。大豆螟虫对大豆和豇豆都有危害，常与豇豆螟虫为伍发生。这种昆虫的幼虫也吃豆荚和生豆子。豆荚里充满了昆虫的粪便，导致豆荚和豆子腐烂。它也可以用来控制蛀虫。
