西药治疗
秋季腹泻一般是由病毒引起的的，所以不要滥用抗生素，应用抗生素治疗不仅无效，反而有害;细菌性痢疾或其它细菌性腹泻，可以应用抗生素，但必须在医生指导之下治疗。
1、 抗病毒治疗可用利巴韦林、潘生丁。
2、 纠正肠道菌群失调的微生态治疗，可用双歧杆菌、嗜酸乳杆菌制剂妈咪爱等生态制剂。
3、 肠黏膜保护剂用蒙脱石粉。
蒙脱石散不进入血液循环服用安全，服用几个小时后随大肠蠕动排出体外，它的主要成分天然蒙脱石微粒对消化道内的病毒、病菌及其产生的毒素气体有极强的固定、抑制作用，且对胃肠粘膜有很强的覆盖保护能力，修复、提高黏膜屏障对攻击因子的防御能力，具有平衡正常菌群和局部止痛作用。
中医治疗
1、外用药
肉桂、丁香各等分研末过120目筛并加入少许陈小粉混匀装入密封瓶备用，用时用藿香正气水调成厚糊状以填满肚脐为度，外覆大小适度的塑料薄膜，最外面用麝香追风膏固定，久泻不止外用药粉中加入少许五倍子粉，皮肤过敏者禁用。
2、内服药
小儿秋季腹泻以3岁以下小儿发病率高，因婴幼儿脾常不足，易于感受外邪，均可导致脾病湿盛而发生泄泻。故用自拟加味平胃散以苍术、厚朴、陈皮、生甘草、车前子、焦山楂、防风为基本方。伴发热加荆芥、苏叶;伴呕吐加姜竹茹、制半夏;伴消化不良加鸡内金、炒谷麦芽;伴湿热加蒲公英、马齿苋。久泻不止用香砂六君丸化裁。
秋季腹泻症状
宝宝得了秋季腹泻后，最主要的症状就是发烧和腹泻，有些患病宝宝最初会呕吐，有些患病宝宝还会同时伴有咳嗽、流鼻涕等感冒症状。
1、起病急，初期常伴有感冒症状，如咳嗽、鼻塞、流涕，绝大多数患儿还会发热，一般为低热，很少高热;
2、半数患儿会出现呕吐。早期呕吐先于腹泻，频繁呕吐，吐出胃内容物和奶汁，呕吐持续2-3天;
3、随后24小时内开始出现腹泻，宝宝的大便次数增多，每日10次左右，大于3次就应考虑秋季腹泻，大便稀薄，呈乳白色、黄色或绿色蛋花汤样，偶尔带少许粘液或脓血，无特殊腥臭味;腹泻的时间可持续约3～5天或一周，少数可长达三周;
4、由于患儿频繁腹泻与呕吐，进食又少，严重者可出现脱水、酸中毒及电解质紊乱，如口渴明显，尿量减少，烦躁不安、精神委靡、嗜睡、神志不清等。如不及时治疗，可发生低血容量性休克进而危及生命。
病情较轻者，经积极治疗，腹泻在一周左右可治愈。婴幼儿轮状病毒腹泻，正常情况下为自限性疾病，且临床表现绝大部分为轻症。
做好家庭护理
家长应仔细观察大便的性质、颜色、次数和大便量的多少，将大便异常部分留做标本以备化验，查找腹泻的原因;要注意腹部保暖，以减少肠蠕动，可以用毛巾裹腹部或热水袋敷腹部。
注意：
注意让婴儿多休息，排便后用温水清洗臀部，防止红臀发生，应把尿布清洗干净，煮沸消毒，晒干再用。
小儿腹泻的食疗方
1、炒米汤：将普通大米洗净，凉干，用大锅炒至金黄色，加水煮粥，给孩子喝粥水。也有止泻作用。
2、葱头饮料：葱头水不太好喝，众所周知，葱头有杀菌，消炎作用。葱头饮料制法：把半个葱头切成小块，加250毫升牛奶，略煮片刻，加适量蜂蜜。最好在睡前饮。
3、姜蛋疗法：取50克生姜加水煮沸，放入鸭蛋2个，搅匀，再加白酒20毫升，盐少许，煎煮5分钟即可，吃蛋喝汤后盖被休息，对秋季感冒、腹泻的防治效果极佳。
4、姜糖水：先用红糖加适量水，煮沸后加生姜，10分钟后趁热喝下，可暖胃。
注意：
1、周岁内的宝宝不适合吃蜂蜜，所以新生儿在使用这些食疗方法的时候，最好不要加蜂蜜哦。
2、食疗偏方里面，新生儿只可以喝汤水质地的方子，太浓稠的怕宝宝太小，以免卡到食道或者喉咙，引起不必要的隐患。
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